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	DNA/RNA分析

软件名称：

jambw 1.1

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软件介绍：

Java语言是一个跨操作平台的语言，用该语言编写的软件，可以跨操作平台使用，只要这个系统有支持Java语言的环境即可。在Windows环境下，IE与Netscape 浏览器均支持Java 语言，所以用 Java语言编写的分子生物学软件JaMBW便是在浏览器下工作的。

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软件名称：

AnnHyb v.4.938

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软件介绍：

DNA工具软件，对短DNA序列，它可进行补体序列生成、融合温度预测、GC百分含量计算、分子量计算、摩尔消光系数计算等功能。增加了许多功能，包括序列检索、注释、编辑，格式转换，限制酶分析、翻译、序列查找、反序与补序、序列统计、ORF查找、寡序列分析、探针分析等等，是一个有用而方便的小工具。

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软件名称：

Chromas

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软件介绍：

一个可打开ABI格式序列文件，查看与编辑的Windows95软件。

开发厂商：

Technelysium Pty Ltd

软件名称：

DNAProbe

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软件介绍：

为了确定蛋白家族新成员的基因序列，常常需要根据蛋白序列对比设计核苷酸序列。 DNAPROBE便是用来帮助在这种情况下进行核苷酸序列设计。

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软件名称：

DnaSP

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DnaSP是一款基因多态性分析软件，输入比对后的DNA序列文件，进行基因多态性分析。

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DFW 2.51 trail

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软件介绍：

DNA for Windows的缩写，是一个易于使用的DNA分析软件，主要用于小规模序列分析，例如用来编辑与显示ABI仪器获得的色谱文件。程序具有DNA翻译与限制酶分析功能，并可以利用外部程序CLUSTALW 进行序列比对。注册费50英镑。

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软件名称：

Artemis R9

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Artemis是a DNA sequence viewer and annotation tool的缩写，为一个免费的DNA序列查看器与注释工具，可以以图形形式查看序列的各种分析结果与特性。以Java写成，需要安装JRE1.2后(5.1M)，直接双击便可执行。程序读取EMBL与GENBANK格式的序列与纯DNA序列，为英国桑格中心推出。使用手册，1M。

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软件名称：

ACT R6

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是Artemis Comparison Tool的缩写，DNA序列比较查看器，基于Artemis程序写成，也是以Java语言推出，需要安装JRE1.2后(5.1M)，直接双击便可执行。。主要用来读取与显示blastx与tblastx的比较结果，也可以读取与图形化查看EMBL与GENBANK数据库的条目，同样为英国桑格中心推出。使用手册，880K。

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GDA 1.1

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GDA为(Genetic Data Analysis)的缩写，主要用来进行不连续基因数据的统计分析，输入文件格式为NEXUS ，BIOSYS ,Weir与GeneStrut 。

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Sequencher 4.7 Demo

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序列拼接软件，还具有ORF分析、蛋白翻译、酶切位点作图、杂合子识别等分析功能。价格单机版3350美元。

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MeltCalc 2.0

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自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件。基于热力学计算，根据输入的核酸序列，自动计算热力学数据，融合温度（Tm)，设计杂交探针。软件不支持引物设计，所以可与Prime3（引物设计）联合使用。

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软件名称：

ConsInspector

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DNA蛋白结合位点预测识别软件。软件包括1996年8月的共有序列库（consensus library）。通过比较预先设定的共有序列库来识别预测共有序列。

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GenomePixelizer 2003.10.1版

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显示基因组中重复基因与基因簇成员之间的相互关系的软件。特别是检测基因组中的重复事件（duplicating events），追踪进化的“足迹”以及显示遗传图等。程序需先安装TCL/TK后（分别为2.5M与1.1M），才能执行。

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GenescanView

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查看基因扫描（genescan）格式.fsa文件并计算峰大小的小软件,意大利University of Padova提供，两个软件均可使用，可能稍有不同

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Sequin

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Sequin是一个独立的程序，由NCBI（美国国家生物情报中心）开发，用来向三大核酸数据库GenBank, EMBL, DDBJ 查询与提交序列数据。非常重要的一个工具软件。英文使用手册，HTML格式；chenqingshan提供的中文使用说明，PDF格式，570K。

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DNAuser 1.0

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软件介绍：

DNAUser, an integrated DNA/Protein analysis tool package for molecular biology/biotech researchers. 一个简单的多功能DNA序列分析软件。由DNAClub更新而来。该软件的开发者为陈雄风研究员，是浙大的客座研究员。DNAuser 1.0汉化版，550K。

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